Апликативната дејност на Земјоделскиот институт се состои од следниве активности:
Стручни и здравствени прегледи на семенски посеви, испитување на квалитетот на семето, како и чување и одржување на дефинитивни примероци од видови и сорти земјоделски растенија – ген банки
Стручен и здравствен преглед на овошен и лозов саден материјал
Постконтролни испитувања, сортни испитувања и др.
Биолошки, физички и хемиски испитувања на препарати
Хемиски анализи на вино, грозје, дестилати и алкохолни пијалоци наменети за увоз и извоз
Хемиска анализа на вештачки ѓубрива
Анализа на вина за дегустација, внатрешен промет и др.
Лабораториска анализа и издавање на сертификат за квалитет на белиот ориз и суровиот ориз
Издавање на уверение за признавање на право за овластен корисник на заштитен географски назив со ознака за потекло “кочански ориз”
